Làm sạch tổ yến, ngâm cho nở mềm trong nước ấm từ 20 – 30 phút.
Nếu hạt sen tươi thì lột vỏ, sử dụng cây tăm xuyên bỏ tim hột sen, rửa sạch. Hạt sen khô thì ngâm trong nước nóng khoảng 1-2g rồi mở lên cho khi mềm là vớt ra. Gừng non gọt vỏ, cắt lát mỏng.
Cho yến đã ngâm nở mềm vào tô, thêm hạt sen, gừng, một chén nước vào tô. Hấp cách thủy khoảng 20 phút cho đến khi hạt sen chín mềm, sau đó cho đường phèn nêm vừa ăn. (Hạt sen có thể nấu riêng rồi cho vào sau). Nếu chưng bằng nồi chưng yến tự động, thời gian chưng khoảng 90 phút.